贵州《铜仁府志》记载的玉米品种有“九子包谷、粘包谷、糯包谷、红包谷、黄包谷”。陕西《紫阳县志》记述的玉米品种就更多了，有象牙白、筒子黄、火炕子、野鸡啄、乌龙早等。其中，野鸡啄“为高山所种，苗长二、三尺许，结包至低，雄可啄食”;与河谷盆地种植的“高至丈许”的玉米品种相比，植株低矮，果穗着生部位低。乌龙早是适应高山地区气候条件种植的早熟品种。还有一种“六十日早”的极早熟玉米品种，可以预防低温灾害，提早成熟。古代人注意玉米留种之法。《农话》记述，玉米应当“采种于丰收田，择完好之穗十分成熟者，去其首尾，采中部之粒藏之”。《区田试种实验图说》在论玉米种子一章中记述:“每年留种时，穗之大者晒之，晒后捆把，挂在屋中。种时将子取下，再采大者为种，小子丢下（取子大苗肥之意）。”这种“掐头去尾留中间”的穗选法，至今仍被玉米农家品种或综合种地区的农民所延用。《农话》对玉米引种栽培有精辟论述，当发现“玉米种之既久，收获渐不如前”的品种退化现象，即需利用种子风选仪进行“另换新种”，“种之佳者，购之北方，因北方之种，成熟早而性能耐寒，移植稍暖之地，更可茂盛也。若以南方之种，种于北方，不但成熟较晚，且须试种数次，方与北方之土性相宜”。这里指出了玉米由不同纬度地区引种的规律，是符合实际的，至今仍具指导意义。整地施肥技术《三农纪》说，玉米“植宜山土”。《救荒简易书》说，“黄子包谷、白子包谷宜种沙地，快包谷易种水地”。特别指出，黄子包谷因为植株高大，果穗更大，其熟亦略晚，尤宜植于山田。还说“包谷喜种重茬……种包谷者，以用红花地底为上等好茬”。20世纪中国玉米种业发展研究越到后来就越益明显，相对于其他作物，玉米的这种负效应尤为突出。由于山区垦种玉米对生态环境造成的破坏不容忽视，在当时落后的生产条件下，流民的垦殖方式主要以毁林烧山为主，山区丰富的森林资源遭到破坏，自然植被大量消失，引起水土流失，使地力衰竭，无法耕种，流失的沙石殃及近山平地，毁坏良田屋舍，下游河流泥沙淤积，洪涝灾害频繁。如在闽、浙、赣、皖山区“于潜、临安、余杭三县，棚民租山垦种，吁陌相连，将山土刨松，一遇淫霖，沙随水落倾注而下，溪河日淀月淤，不能容纳，与湖郡之孝丰、安吉、武康三县，长兴之西南境，乌程之西境为害同，惟积难返，扫除不易。”①随着山区水土流失的加重，农业土壤及肥力流失，有的几乎无土，只存石头，有的只存痔壤，肥力下降，普遍出现“粪种亦不能多获者”的局面，棚民只好另寻他处垦殖，这样辗转开垦必然导致耕地的滥行扩张和水土流失范围的扩大。
田少山多，坡破晓确之处皆种包谷。初垦时不粪自肥，阅年即久，浮土为雨潦洗尽，佳壤尚可粪种，痔处终岁辛苦，所获无几。生态环境遭到破坏是粮食生产不利条件之一，这在一定程度上导致了清后期粮食亩产下降，农业产出减少。这亦提醒我们在现今农业开发过程中一定要吸取历史教训，遵循自然规律，坚持可持续发展原则，以实现农业持续发展。
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