中药超细粉碎机堵塞是粉碎机使用中比较常见的故障，有可能是机器本身设计存在的问题，但更多是由于使用者操作不当造成的。发生堵塞现象一般可以通过以下三个方面进行检查：
1、物料进料速度过快，负荷增大，造成堵塞。在进料过程中，要随时注意电流表指针偏转角度大，如果超过额定电流，表明电机超载，长时间过载，会烧坏电机。出现这种情况应立即减小或关闭料门，也可以改变进料的方式，通过增加喂料器来控制进料量。喂料器有手动、自动两种，用户应根据实际情况选择合适的喂料器。由于超细粉碎机转速高、负荷大，并且负荷的波动性较强。所以机器工作时的电流一般控制在额定电流的90％左右。
2、出料管道不畅或堵塞进料过快，会使粉碎机风口堵塞与输送设备匹配不当会造成出料管道风减弱或无风后堵死。查出故障后，应先清通送口变更不匹配的输送设备，调整进进料量，使设备正常运行。
3、锤片断裂、老化，筛网孔堵塞、破烂，粉碎的物料含水量过高都会使粉碎机堵塞。应定期更新折断和严重老化的锤片，保持粉碎机良好的工作状态，并定期检查筛网，粉碎的物料含水率应低于14％，这样既可提高生产效率，又使粉碎机不堵塞，增强粉碎机工作的可靠性。
由于中药超细粉碎机自身高速打磨震动的特点，其部件的磨损老化也是常见和合理的，希望操作者在使用过程中能注意到这点。
