采用巴氏杀菌法，对各类包装产品蔬菜或罐装食品通过温度自动调节，将杀菌槽中的热水温度控制在80-90摄氏度之间，即能起到杀菌效果，又能保证蛋白质等营养成份不在较大温度范围内波动，保持食品原有的品质，达到对食品不加防腐剂和添加剂，而延长保质期，从而保护了人们的生命健康。同时对杀菌后的物品通过能却水进行冷却并用强风将包装 物表面吹干后包装入库可延长食品储藏期。
巴氏杀菌机原理在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。
在食品、饮料、制药等行业中，要求对一些包装完毕的产品进行水浴灭菌。被包装好的产品放在可调速的不锈钢网带上，在传送带的作用下按序进入灭菌箱体内，经由“高温水为介质”杀菌后，再由传送带带人冷却箱体内均匀冷却，从而达到产品杀菌要求。该系列设备连续运转，已灭菌的包装产品被源源 不断送入下一生产工序。
巴氏杀菌机是是将温度控制仪设定好PU值给转化为各温区水槽的实际控制温度的曲线，在通过对于温度的检测准确的控制各温区的温度的变化。主传动电机带动上下两层的输瓶链网将物料一次的经过三个温区的逐级的升温预热，和两个温区的杀菌以及三个温区的逐级的降温和冷却的过程。
巴氏杀菌机使用方法：
1、接通电源，该设备为三相四线，其中一根双色线为零线(请专业人员进行接线作业，以防对设备造成损坏);
2、打开电源开关，设定温度;设定温度过程为：按SET，按右键调适需要调整的位数，按上下键设定具体的数值，设定好后再按一次SET键确认;
3、打开杀菌开关，设备开始升温，温度升到设定值后自动停止;在工作过程中温度下降升温自动工作;
4、温度升到设定值后，打开，网带开始运行，进行杀菌;
5、网带运行速度用电器箱内部的变频器进行调整，旋钮顺时针旋转为提高速度，反之速度降低。
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