食品微生物检测箱采样前要了解所采样品的来源、加工、储藏、包装、运输等情况，采样时必须做到:使用的器械和容器需经灭菌，严格进行无菌操作;不得加防腐剂;液体样品应搅拌均匀后才去采样，固体样品应在不同部位采取以使样品具代表性;取样后及时送检。
食品微生物标准委员会(ICMSF)制定的食品微生物学分析采样方法，目前已在国内外被逐步推广采用。ICMSF根据以下原则来规定不同的采样数:①各种微生物本身对人的危害程度各有不同;②食品经不同条件处理后，其危害程度可分为3种情况:危害度降低;危害度未变;危害度增加。依据ICMSF采样方法规定，其中:n:指一批产品采样个数;c:指该批产品中检样菌数超过*的检样数;m:指合格菌数*;M:指附加条件后判定为合格的菌数*。
食品微生物检测箱
采集好的样品应及时送到食品微生物检验室，一般不应超过3h，如果路程较远，可将不需冷冻的样品保持在1~5℃的环境中，勿使冻结，以免细菌遭受破坏。
样品送检时，必须认真填写申请单，以供检验人员参考。
检验人员接到送检单后，应立即登记，填写序号，并按检验要求，立即将样品放在冰箱或冰盒中，并积极准备条件进行检验。
(3)样品处理
样品处理应在无菌室内进行，若是冷冻样品必须事先在原容器中解冻，解冻温度为2~5℃不超过18h或45℃不超过15min。
a.固体样品
用无菌刀、剪或镊子称取不同部位的样品，剪碎放入灭菌容器内，加一定量的水混匀，制成1: 10混悬液，进行检验。在处理蛋制品时，加入约30个玻璃球，以便震荡均匀。生肉及内脏，*行表面消毒，再剪去表面样品，采集深层样品。
b.液体样品
原包装样品用点燃的酒精棉球消毒瓶口，再用经石炭酸或来苏儿消毒液消过毒的纱布将瓶口盖住，用经火焰消毒的开关器开启。摇匀后用无菌吸管吸取;含有二氧化碳的液体食品，按上述方法开启瓶盖后，将样品倒入无菌磨口瓶中，盖上消毒纱布，将盖开一小缝，轻轻摇动，使气体逸出后进行检验;将冷冻食品放入无菌容器内，融化后检验。
