考虑到河水污染严重，水中的有机污染物、色度、胶体物含量比较大，故采用吸附能力较强的活性炭，用于深度过滤。
经过石英砂过滤器过滤后的水进入活性炭过滤器，活性炭过滤器内装填果壳型活性炭。活性炭的功能主要是吸附过滤，广泛应用在除去水中有机杂质和水中分子态胶体微细颗粒杂质，也可用于吸附水中的余氯、色度、臭味等。活性炭表面和内部布满了微孔，微孔直径平均2～5nm，当分子级杂质直径接近活性炭微孔直径时，就很容易被吸附。活性炭具有600～1200㎡/g的表面积和0.6～1.0m3/g的内孔体积，其吸附性能较强。此外活性炭表面有大量的羟基和羧基等官能团，可以对各种性质的有机物质进行化学吸附、以及静电引力作用。通常，能够去除63～86%胶体物质，50%左右的铁，47%～60%的有机物。
活性炭过滤器结构底部装填砾石作为承托层，上面装1.8m厚的活性炭层。原水由顶部导入，顺流自然下降过滤。活性炭过滤器运行一段时间后，因截污量过多，暂时失去活性，此时应进行反洗、排污，反洗清水从底部进入，反洗强度为8～10L/（cm2），反洗至出水清澈为止。活性炭使用期随水质而异，正常运转下可使用1年左右，当活性炭失效时，应予以更新。
