冷冻干燥也应用于化学分析中，它能得到干燥态的样品，或者浓缩样品以增加分析敏感度。冻干使样品成分稳定，也不需改变化学组成，是理想的分析辅助手段。冷冻干燥可以自然发生。
设备优点：
1、冷冻干燥在低温下进行，因此对于许多热敏性的物质特别适用。如或失去生物活力。
2、在低温下干燥时，物质中的一些挥发性成分性质损失很小，保持原有的营养成分。
3、在冷冻干燥过程中，微生物的生长和酶的作用无法进行，因此能保持原来的形状。
4、由于在冻结的状态下进行干燥，因此体积几乎不变，保持了原来的结构，不会发生浓缩现象。
5、干燥后的物质疏松多孔，呈海绵状，加水后溶解迅速，几乎立即恢复原来的形状。
6、由于干燥在真空下进行，氧气极少，因此一些易氧化的物获得了保护。
7、干燥能排除95%-99%以上的水份，使干燥后的产品能长期保存而不致变质。
