微波萃取设备是利用微波对介质进行萃取的，微波对物料实施立体加热，提高萃取率。在微波场中，各种物料吸收微波能力的差异使得基体物质的某些区域或萃取体系中的某些成分被选择性加热，从而使得物质内部产生能量差或势能差，被萃取物质得到足够的动力即从基体或体系中分离出来。微波萃取的机理可从两方面进行理解。
一方面微波所产生的电磁场加速被萃取部分成分向萃取溶剂界面扩散速率，用水作溶剂时，在微波场下，水分子高速转动成为激发态，这是一种高能量不稳定状态，或者水分子汽化，加强萃取组分的驱动力；或者水分子本身释放能量回到基态，所释放的能量传递给其他物质分子，加速其热运动，缩短萃取组分的分子由物料内部扩散到萃取溶剂界面的时间，从而使萃取速率提高数倍，同时还降低了萃取温度，较大限度保证萃取的质量。
另一方面，微波加热设备的原理辐射过程是高频电磁波穿透萃取介质，到达物料的内部维管束和腺胞系统。由于吸收微波能，细胞内部温度迅速上升，使其细胞内部压力超过细胞壁膨胀承受能力，细胞破裂。细胞内有效成分自由流出，在较低的温度条件下萃取介质捕获并溶解。通过进一步过滤和分离，便获得萃取物料。
罐式微波萃取设备也称微波萃取罐或微波提取设备，由罐体、微波作用腔、搅拌器、加料口、加液口、微波源、出料口及出液口组成。该设备与常规动态提取罐结构相仿，不同之处是将蒸汽夹套加热改为微波腔加热，将平面加热改为立体加热，热源由蒸汽夹套壁改为料液本身的发热。可适用对块状、片状、颗粒状、粉状物料的提取，可以进行保温、恒温、常压、正压、负压提取，并可满足不同中草药提取的工艺参数要求。装机微波功率容量可从数百瓦到数百千瓦，罐体容积可从几十毫升到数立方米。现场实践证实一台1立方米微波萃取设备的处理能力相当于5～8立方米常规动态提取罐的处理能力。其缺点是微波萃取生产线微波装机功率较大、制造难度较高，提取生产线只能分批次作业，加料、进液、出液、出渣等辅助时间较长，降低了整机的利用率。需要指出的是鉴于微波穿透深度有限，微波萃取设备必须配备搅拌器，实现动态提取。：
一方面微波所产生的电磁场加速被萃取部分成分向萃取溶剂界面扩散速率，用水作溶剂时，在微波场下，水分子高速转动成为激发态，这是一种高能量不稳定状态，或者水分子汽化，加强萃取组分的驱动力；或者水分子本身释放能量回到基态，所释放的能量传递给其他物质分子，加速其热运动，缩短萃取组分的分子由物料内部扩散到萃取溶剂界面的时间，从而使萃取速率提高数倍，同时还降低了萃取温度，较大限度保证萃取的质量。
另一方面，微波加热设备的原理辐射过程是高频电磁波穿透萃取介质，到达物料的内部维管束和腺胞系统。由于吸收微波能，细胞内部温度迅速上升，使其细胞内部压力超过细胞壁膨胀承受能力，细胞破裂。细胞内有效成分自由流出，在较低的温度条件下萃取介质捕获并溶解。通过进一步过滤和分离，便获得萃取物料。
罐式微波萃取设备也称微波萃取罐或微波提取设备，由罐体、微波作用腔、搅拌器、加料口、加液口、微波源、出料口及出液口组成。该设备与常规动态提取罐结构相仿，不同之处是将蒸汽夹套加热改为微波腔加热，将平面加热改为立体加热，热源由蒸汽夹套壁改为料液本身的发热。可适用对块状、片状、颗粒状、粉状物料的提取，可以进行保温、恒温、常压、正压、负压提取，并可满足不同中草药提取的工艺参数要求。装机微波功率容量可从数百瓦到数百千瓦，罐体容积可从几十毫升到数立方米。现场实践证实一台1立方米微波萃取设备的处理能力相当于5～8立方米常规动态提取罐的处理能力。其缺点是微波萃取生产线微波装机功率较大、制造难度较高，提取生产线只能分批次作业，加料、进液、出液、出渣等辅助时间较长，降低了整机的利用率。需要指出的是鉴于微波穿透深度有限，微波萃取设备必须配备搅拌器，实现动态提取。：
