菌机的种类比较多，一般灭菌机的产品分类是根据其杀菌工艺、灭菌机的特性、以及灭菌机的用途三个方面进行分类的。
　　
　　根据灭菌机的杀菌工艺可以分类为：高温灭菌机、巴氏灭菌机、微波灭菌机、超声波灭菌机、喷淋灭菌机、电离灭菌机等；
　　
　　根据灭菌机特性的不同可以分类为：管式灭菌机、电离灭菌机、板式巴氏灭菌机等；
　　
　　根据灭菌机的用途不同可以分为：实验灭菌机、食品灭菌机、化工灭菌机等；
　　
　　根据灭菌机的杀菌方式的不同：可以分为连续式灭菌机、喷淋巴氏灭菌机、回转式灭菌机、微波干燥灭菌机等。