杀菌锅其主要功能就是杀菌，而杀菌工艺就是控制该锅在使用中这几个控制因素的，但由于该过程受多方面影响杀菌时间并不固定。影响杀菌锅杀菌时间的因素如下：
1、保质期：保质期不同要求的杀菌强度也就不同，更直接表现是保温的时间不同。保质期要求的越长,产品的保温时间也就要求越长。
2、大小厚度：200克的产品跟1000克的产品的保温时间肯定不同。产品越厚越大产品需要的保温时间也就越长。
3、杀菌温度：杀死芽孢杆菌121摄氏度四分钟不是它的致死条件。温度降低时间相应的延长也可以,比如选用115度杀菌时，保温时间就需要比选用121度保温时间延长20分钟。
4、初温：产品进杀菌锅前的初始温度不同，需要吸收的热量也就不同。产品的处温越低要求的保温时间也就越长。
5、菌落初始量：理论上杀死1000个细菌和杀死1000万个细菌需要的热量是不一样的。产品的初始细菌量越多需要的保温时间也就越长。
操作步骤： 1、把产品装入锅内，密封好锅门，关闭手动联锁，打开充气垫阀门，打开保压开关往锅内注入压力，锅内压力设为0.18-0.2Mpa。
2、打开杀菌开关注入蒸汽，打开上手动排气阀门，把上层冷气排掉，随手关闭，再打开下手动排气阀门把下层冷气排掉，随手关闭。
3、开始杀菌升温，锅内温度设为121，当升到一定温度时，自动保温记时，保温时间为15-30分钟(供参考数值)。当保温时间到设定温度时会自动报警，关闭杀菌开关停止进蒸汽。
4、打开上手动阀门，保持锅内压力，自动进冷空气降温，把温度降到80-40之间，关闭上手动排气阀门和保压开关。
5、打开下手动排水阀门，把锅内的水全部排掉，随手关闭此阀门，打开上或下手动排气阀门，把锅内的压力全部排掉，随手关闭此阀门。
6、关闭充气垫阀门，打开放气垫阀门，打开手动联锁，打开锅门取货。
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