软包装杀菌机是一种利用较低的温度既可杀死病菌又能保持物品中营养物质风味不变的消毒设备，现在常常被广义地用于定义需要杀死各种病原菌的热处理方法。
在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快（一般微生物生长的适宜温度为28℃—37℃）。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的适合生长温度和耐热、耐冷能力。
软包装杀菌机消毒的原理其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。
巴氏杀菌属于低温杀菌，温度多是在65度－95度之间，可根据食品本身的特性来确定水浴杀菌时的温度，一般用低温巴士杀菌后的产品相对比高温杀菌的产品保质期要短一些。
在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢，巴氏杀菌消毒是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经低温消毒后，仍保存小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢，因此巴士杀菌后的食品要在4℃左右的温度下保存，且保存时间不能过长。
巴氏杀菌的过程就是在进行包装工作后，就可以进入水浴式低温杀菌进行消毒灭菌了，首先根据食品工业要求及本身特性，设定合适的水温及杀菌时间，可通过调节杀菌设备的网带运行速度来设定杀菌时间，杀菌后的产品要进入到冷却线中进行冷却工作，才能保证产品的口感不变，冷却后要进行振动沥水风干，目的是保证产品的表面没有水分，然后就是进行装箱工作了，至此杀菌工作完成。
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