黄芪烘干机在烘干过程中，黄芪若直接进入适宜糖分转化的高温环境，大地温差使黄芪发生生物保护反应,表皮细胞孔收缩，结壳硬化，阻止黄芪内部水分蒸发。所以在黄芪烘干前期需要足够的预热，逐步加温，为水分大量蒸发作准备。35℃时保持6～10小时，当黄芪温达45℃时，稍感烫手，待7～8小时后，用力压黄芪会出现皱纹，黄芪温达45～48℃时，黄芪表面会出现一层小水珠。
黄芪烘干房使黄芪内部的游离水大量蒸发，此时，需提高温度在8～12小时内使烘干机内达到65℃，不要超过70℃。以利水分大量蒸发，并注意减湿，并保持室内温度不要有大的变化，以便持续不停地蒸发水分。当黄芪表面出现皱纹时，说明干燥正常。
当黄芪烘干设备烘干黄芪的温度均匀一致，在6个小时内可完成此阶段工作。因为后期黄芪水分已不多，应需注意温度控制，切勿过大，以50℃为佳。此时相对湿度也降了下来，如高于60%时可稍加排湿，随着黄芪内水分逐渐平衡，也就达到烘干的目的了。注意把烘干好的样品及时卸出来。
