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《燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法》征求意见稿发布

2021-01-13 09:37:29 来源：化工仪器网 阅读量：6022

　　燕麦嗜酸菌西瓜亚种是近年由国外传入的毁灭性病害，除为害西瓜外，还会为害黄瓜和西葫芦，病菌附着在种子或病残体上越冬，曾导致了严重的经济损失，80%的西瓜不能上市销售。该病菌在世界范围内广泛分布，寄主众多，对该病原菌来源地、宿主等信息进行溯源，明确宿主、来源地与物种生物信息之间的规律性，有利于掌握病菌致病规律，从而能有效制定相应的预警和防控策略。
 
　　根据“十三五”国家重点研发计划专项“国家质量基础的共性技术研究与应用”中《高频跨境生物多目标高精准检测技术研究》项目，中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、深圳市检验检疫科学研究院筛选研究适用于燕麦嗜酸菌西瓜亚种寄主、来源地等溯源信息的核酸基因片段，通过生物信息学、统计学、群体生态学等研究技术和方法构建了溯源信息的系统进化和网络进化关系对物种归类鉴定，并于近日发布了《燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法》征求意见稿。
 
　　《燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法》的内容包括有范围、病菌的基本信息、方法原理、仪器用具、溯源检测方法、结果判断、样品与原始数据集保存以及资料性附录。标准规定了应用生物信息学分析方法对燕麦嗜酸菌西瓜亚种进行溯源检测的方法，其原理是通过对物种具有溯源价值和意义的基因片段的扩增，利用已完成的核酸序列与系统进化和网络进化图对物种进行归类鉴定，检测过程是应用生物信息学的分析手段筛选有效区分种内差异并且有效归类的基因片段或分子标记获得这些基因片段或分子标记的核酸序列，应用统计学手段完成核酸序列与来源地、寄主信息的主成分分析，完成不同来源地、寄主个体的群体分子系统净化关系和群体结构分析。
 
　　为确保试验的顺利进行，标准中还规定了需要用到保湿培养箱、超净工作台、灭菌箱、-80℃低温冰箱、pcr扩增仪、冷冻离心机、核酸蛋白分析仪、电泳仪、凝胶成像系统、高压灭菌锅等精密仪器设备。
 
　　本标准的实施，不仅可以快速、准确、简便的对燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源信息进行检测，也可以为燕麦嗜酸菌西瓜亚种寄主植物及植物产品的进境和管理提供技术保障。故而希望相关单位能在规定时间内仔细研核本标准征求意见稿，并提出建设性意见，为标准的进一步完善添砖加瓦。
 

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